La Fondation Émile Chanoux est dirigée par un Conseil d’Administration de 9 membres dont 3 sont nommés par le Gouvernement de la Région Autonome Vallée d’Aoste, 3 par le Centre International de Formation Européenne (CIFE) et les 3 derniers sont cooptés par les membres en fonction. Ils élisent parmi eux leur président.
Le Conseil dicte les orientations générales et les lignes directrices de l’activité de la Fondation, alors que les fonctions opérationnelles sont du ressort du secrétaire général.

Le Conseil d’Administration actuel arrive à échéance de son mandat le 5 juin 2010. Les candidatures pour son renouvellement peuvent être adressées au dirigeant du secrétariat du Gouvernement régional en utilisant le formulaire disponible sur le site de la Région Autonome Vallée d’Aoste.  Il est maintenant composé de :
Franco Cometto
 Président  nommé RAVA
Nicolas Schmitt
 Vice-Président    
 coopté
Stefania Lamotte
 conseillère  nommée RAVA
Simone Voyat
 conseiller  nommé RAVA
Massimo Michaud
 conseiller  coopté
César Dujany
 conseiller  coopté
Frédéric Lépine
 conseiller  nommé CIFE
Jean-Pierre Jardel          
 conseiller
 nommé CIFE
Hartmut Marhold
 conseiller
 nommé CIFE
Les conseillers ne perçoivent aucune rétribution ni aucun jeton de présence pour leur participation aux réunions du Conseil d’Administration. Ils peuvent être joints par courriel à l’adresse suivante info@fondchanoux.org ou un message peut leur être adressé par téléphone au numéro de la Fondation Chanoux, 0165 40777.

Le statut prévoit aussi un comité des réviseurs composé de deux membres effectifs et un suppléant. Cet organe aussi arrive à échéance le 5 juin 2010 et les éventuelles candidatures pour son renouvellement peuvent être déposées suivant la même procédure indiquée pour le Conseil d’Administration. Les réviseurs aux comptes actuellement en fonction sont :
Mario Verrino
Président du comité de révision    
nommé RAVA
Amedeo Maria Parini     
réviseur aux comptes
nomméRAVA
Martin Ricketts
réviseur aux comptes
nommé CIFE
Luca Poggianti
réviseur suppléant
nommé RAVA
L’équipe qui s’occupe du fonctionnement quotidien de la  Fondation Chanoux est composée de :
Etienne Andrione       
secrétaire général
Patrick Perrier
secrétaire de direction / chercheur
Alberto Bertin
chercheur
Alberto Bertin se trouve en disponibilité depuis le 1er juillet 2008 pour l’exercice de fonctions publiques.
Le taux d’absence de l’ensemble de l’équipe de la Fondation Chanoux est de 2%.

(Données publiées conformément à l'art. 14, alinéa 10 et 11 de la loi régionale 11 décembre 2009, n. 47)