La Fondation Émile Chanoux est dirigée par un Conseil d’Administration de 5 membres dont 3 sont nommés par le Gouvernement de la Région Autonome Vallée d’Aoste et 2 par le Centre International de Formation Européenne (CIFE). Ils élisent parmi eux leur président.
Le Conseil dicte les orientations générales et les lignes directrices de l’activité de la Fondation, alors que les fonctions opérationnelles sont du ressort du secrétaire général.

Le Conseil d’Administration actuel a été nommé le 5 novembre 2010 pour une durée de 5 ans. Il est composé de :
Alessandro Celi
 Président  nommé RAVA
Nicolas Schmitt
 Vice-Président    
 nommé CIFE
Marie-Rose Colliard
 conseillère  nommée RAVA
Manuela Lucianaz
 conseillère  nommé RAVA
César Dujany  conseiller  nommé CIFE
Monsieur Franco Cometto a été nommé Président d'honneur.

Les conseillers ne perçoivent aucune rétribution
ni aucun jeton de présence pour leur participation aux réunions du Conseil d’Administration. Ils peuvent être joints par courriel à l’adresse suivante info@fondchanoux.org ou un message peut leur être adressé par téléphone au numéro de la Fondation Chanoux, 0165 40777.

Le statut prévoit aussi un comité des réviseurs composé de 2 membres  effectifs et 1 suppléant nommés par le Gouvernement de la Région Autonome Vallée d’Aoste et 1 membre  effectif et 1 suppléant nomméspar le Centre International de Formation Européenne (CIFE) . Les réviseurs aux comptes actuellement en fonction sont :
Mario Verrino
Président du comité de révision    
nommé RAVA
Amedeo Maria Parini     
réviseur aux comptes
nomméRAVA
Andrea Distrotti
réviseur aux comptes suppléant
nomméRAVA
L’équipe qui s’occupe du fonctionnement quotidien de la  Fondation Chanoux est composée de :
Etienne Andrione       
secrétaire général
Patrick Perrier
secrétaire de direction / chercheur
Alberto Bertin
chercheur
Alberto Bertin se trouve en disponibilité non rétribuée depuis le 1er juillet 2008 pour l’exercice de fonctions publiques.
Le taux d’absence de l’ensemble de l’équipe de la Fondation Chanoux est de 14%. Ce pourcentage n'est du, pour l'année 2010, qu'au congés prévus dans le cadre des contrats de travail.

(Données publiées conformément à l'art. 14, alinéa 10 et 11 de la loi régionale 11 décembre 2009, n. 47)